Existují dva způsoby sterilizace lékařských nástrojů používaných v chirurgii, a to vysokoteplotní sterilizace a nízkoteplotní sterilizace.
1. Vysokoteplotní sterilizační metoda spočívá v použití vysokého tepla k denaturaci mikrobiálních proteinů k dosažení účelu zabíjení bakterií. Je klinicky nejpoužívanější a běžně se používá tlaková parní sterilizace, která je vhodná pro nástroje a předměty, které snesou vysokou vlhkost a teplo. K dispozici je také blesková parní sterilizace, kterou lze použít pro holé nástroje a předměty.
Za druhé, nízkoteplotní sterilizace, často využívající sterilizaci ethylenoxidem. Nejklinickější použití, výhodou je, že nepoškozuje sterilizované předměty, má silnou penetrační schopnost a má dobrý účinek na hubení mikroorganismů. Nízkoteplotní formaldehydovou parní sterilizaci lze použít pro zdravotnické prostředky, které nesnesou vysoké teploty.





